Kanon Kôzuki, de 23 años, lleva ocho enamorada perdidamente de Kôsuke Sakai, al que ha adorado cual deidad. Y, poco a poco, lo que siente hacia él se vuelve más cercano tras su reencuentro. Sôsuke vive luchando contra seres alienígenas, conocidos popularmente como amebas. Los que, como él, se enfrentan a ellas acaban pasando por unas “reparaciones” para poder sobrevivir, con lo que ven modificados sus recuerdos y gustos. ¡¿Por qué de repente ese amor prohibido aparece entre Kanon y Sôsuke?!